56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2216 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  72.77 
 
 		 665 aa  960    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  100 
 
 		 650 aa  1295    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  52.92 
 
 		 684 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  50.97 
 
 		 674 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  48.9 
 
 		 673 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  40.96 
 
 		 658 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  43.61 
 
 		 677 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  43.77 
 
 		 675 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  43.77 
 
 		 675 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.76 
 
 		 699 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  42.63 
 
 		 682 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.06 
 
 		 657 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  40.84 
 
 		 695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.12 
 
 		 653 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  35.07 
 
 		 690 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  34.15 
 
 		 675 aa  392  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  33.54 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  39.8 
 
 		 683 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  34.93 
 
 		 688 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.81 
 
 		 714 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.31 
 
 		 658 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.25 
 
 		 661 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  40.13 
 
 		 683 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  39 
 
 		 679 aa  346  8.999999999999999e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  53.08 
 
 		 346 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  40.47 
 
 		 663 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  39.33 
 
 		 658 aa  331  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  55.06 
 
 		 355 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  50.15 
 
 		 347 aa  290  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  50.15 
 
 		 347 aa  290  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.36 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.36 
 
 		 578 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  38.16 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  38.29 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  38.29 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.84 
 
 		 685 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  40.98 
 
 		 616 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  39.29 
 
 		 525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  39.29 
 
 		 525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  52.25 
 
 		 326 aa  267  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  42.08 
 
 		 676 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.47 
 
 		 671 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  40.38 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  40.38 
 
 		 642 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.32 
 
 		 513 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.48 
 
 		 500 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  46.52 
 
 		 326 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.01 
 
 		 649 aa  210  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.28 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.12 
 
 		 649 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  46.46 
 
 		 373 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  39.68 
 
 		 437 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.75 
 
 		 650 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.5 
 
 		 341 aa  177  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.16 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 		 747 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>