61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5948 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 699 aa  1400    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  46.56 
 
 		 683 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  44.89 
 
 		 695 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  47.4 
 
 		 657 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  46.35 
 
 		 677 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  46.03 
 
 		 675 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  46.03 
 
 		 675 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  44.06 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.62 
 
 		 653 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  38.6 
 
 		 675 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  46.14 
 
 		 684 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  41.91 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  43.92 
 
 		 674 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  44.76 
 
 		 650 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  36.17 
 
 		 688 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  36.61 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  36.68 
 
 		 689 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  43.27 
 
 		 665 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.45 
 
 		 673 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.96 
 
 		 714 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.57 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  40.06 
 
 		 679 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.18 
 
 		 658 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  41.57 
 
 		 683 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  39.62 
 
 		 658 aa  335  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.52 
 
 		 578 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  40.52 
 
 		 671 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.52 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  40.33 
 
 		 671 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  40.33 
 
 		 671 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  38.45 
 
 		 663 aa  326  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  42.35 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  42.35 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.59 
 
 		 671 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44 
 
 		 685 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  39.02 
 
 		 616 aa  310  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  41.47 
 
 		 676 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  40.61 
 
 		 642 aa  303  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  40.61 
 
 		 645 aa  303  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.62 
 
 		 560 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  47.14 
 
 		 347 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  47.14 
 
 		 347 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.48 
 
 		 346 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.87 
 
 		 500 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.93 
 
 		 649 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.93 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.6 
 
 		 650 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.34 
 
 		 513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.98 
 
 		 373 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  45.59 
 
 		 355 aa  223  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.9 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  43.57 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  48.3 
 
 		 326 aa  217  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 341 aa  213  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.22 
 
 		 747 aa  193  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  39.94 
 
 		 326 aa  173  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1460 aa  52  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  28.49 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 398 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 398 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 398 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>