50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2589 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 1460 aa  3033    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3555  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1005 aa  138  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406445  normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0091  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  111  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  49.12 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.35 
 
 		 373 aa  58.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  35.71 
 
 		 677 aa  55.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  36.36 
 
 		 675 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  36.36 
 
 		 675 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  54.9 
 
 		 437 aa  54.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  45.76 
 
 		 676 aa  54.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.86 
 
 		 673 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0445  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.64 
 
 		 573 aa  52.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  41.46 
 
 		 355 aa  52.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  47.69 
 
 		 671 aa  52.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  52.08 
 
 		 684 aa  51.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  49.02 
 
 		 650 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  38.89 
 
 		 675 aa  51.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  48.33 
 
 		 616 aa  50.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  46.67 
 
 		 663 aa  50.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 		 649 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  44.78 
 
 		 645 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  46.81 
 
 		 500 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  44.78 
 
 		 642 aa  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 		 649 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 674 aa  48.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  31.76 
 
 		 688 aa  48.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.97 
 
 		 346 aa  48.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.83 
 
 		 685 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  36.47 
 
 		 658 aa  48.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  40.85 
 
 		 690 aa  48.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.95 
 
 		 699 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0455  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 590 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  34.31 
 
 		 695 aa  47.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  30.59 
 
 		 689 aa  47.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.64 
 
 		 560 aa  47  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  47.83 
 
 		 671 aa  46.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  47.83 
 
 		 671 aa  47  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  47.83 
 
 		 525 aa  47  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  47.83 
 
 		 671 aa  46.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.83 
 
 		 578 aa  47  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.83 
 
 		 578 aa  47  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  47.83 
 
 		 525 aa  47  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  46.67 
 
 		 682 aa  46.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  46.94 
 
 		 714 aa  46.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  52.63 
 
 		 653 aa  45.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  34.69 
 
 		 326 aa  45.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.33 
 
 		 658 aa  45.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  51.11 
 
 		 658 aa  45.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 347 aa  45.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 347 aa  45.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>