58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1504 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 653 aa  1360    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  46.72 
 
 		 657 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  39.06 
 
 		 690 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  40.61 
 
 		 675 aa  474  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.92 
 
 		 699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  39.06 
 
 		 688 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  38.6 
 
 		 689 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  41.08 
 
 		 695 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  40.21 
 
 		 677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  41.43 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  40.35 
 
 		 675 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  40.35 
 
 		 675 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  40.13 
 
 		 682 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  39.49 
 
 		 674 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  39.12 
 
 		 650 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  38.04 
 
 		 665 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.57 
 
 		 714 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  38 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.94 
 
 		 684 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.14 
 
 		 673 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.08 
 
 		 658 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.36 
 
 		 661 aa  330  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  34.97 
 
 		 679 aa  316  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  38.64 
 
 		 676 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  36.61 
 
 		 616 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  37.79 
 
 		 683 aa  313  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  37.01 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  35.52 
 
 		 671 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  35.52 
 
 		 671 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  35.35 
 
 		 671 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.9 
 
 		 578 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  35.8 
 
 		 525 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  35.8 
 
 		 525 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.59 
 
 		 685 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.19 
 
 		 671 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  35.03 
 
 		 663 aa  289  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  32.17 
 
 		 642 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  32.17 
 
 		 645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.57 
 
 		 346 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.31 
 
 		 500 aa  241  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.52 
 
 		 513 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.85 
 
 		 560 aa  233  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.82 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.46 
 
 		 649 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.29 
 
 		 347 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.16 
 
 		 649 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.29 
 
 		 347 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 650 aa  218  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  39.58 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  37.97 
 
 		 437 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.43 
 
 		 341 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 		 433 aa  180  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  42.62 
 
 		 326 aa  164  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.8 
 
 		 747 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  40.24 
 
 		 326 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  30.69 
 
 		 399 aa  48.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1460 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>