60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0318 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  67.92 
 
 		 690 aa  922    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  67.93 
 
 		 689 aa  949    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  67.1 
 
 		 688 aa  945    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  100 
 
 		 675 aa  1372    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.17 
 
 		 657 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  38.97 
 
 		 683 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.61 
 
 		 653 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.6 
 
 		 699 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  40 
 
 		 695 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  38.44 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  38.44 
 
 		 682 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  38.81 
 
 		 675 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  38.81 
 
 		 675 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  38.07 
 
 		 674 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.18 
 
 		 684 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.92 
 
 		 673 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  37.03 
 
 		 658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.82 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  32.9 
 
 		 665 aa  364  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  33.44 
 
 		 683 aa  347  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  31.99 
 
 		 679 aa  337  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 		 658 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.48 
 
 		 661 aa  324  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  30.53 
 
 		 663 aa  315  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.84 
 
 		 578 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  35.84 
 
 		 671 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  35.62 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  35.62 
 
 		 525 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  35.62 
 
 		 671 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.62 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  35.62 
 
 		 671 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 685 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  38.92 
 
 		 616 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.44 
 
 		 560 aa  264  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  36.07 
 
 		 676 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  38.33 
 
 		 645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.47 
 
 		 671 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  38.08 
 
 		 642 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.25 
 
 		 346 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.33 
 
 		 347 aa  237  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.33 
 
 		 347 aa  237  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  34.03 
 
 		 437 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.89 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 649 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 		 649 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.96 
 
 		 500 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.23 
 
 		 373 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  40.13 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.45 
 
 		 650 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.14 
 
 		 433 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.42 
 
 		 341 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  33.22 
 
 		 326 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  33.94 
 
 		 326 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.23 
 
 		 747 aa  163  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1460 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1399  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 602 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 417 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>