57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4999 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 341 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  46.25 
 
 		 433 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.43 
 
 		 653 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  43.01 
 
 		 675 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  43.01 
 
 		 675 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 699 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  43.37 
 
 		 677 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.33 
 
 		 560 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  34.8 
 
 		 690 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  36.54 
 
 		 689 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.45 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.45 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.57 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.14 
 
 		 657 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.02 
 
 		 649 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.02 
 
 		 649 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  39.15 
 
 		 688 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.7 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.98 
 
 		 661 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  40.54 
 
 		 658 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  34.42 
 
 		 675 aa  178  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  41.91 
 
 		 683 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  39.73 
 
 		 658 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  38.54 
 
 		 674 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  36.86 
 
 		 682 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  38.57 
 
 		 683 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.68 
 
 		 650 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 673 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 650 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  41.41 
 
 		 437 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  41.2 
 
 		 663 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.62 
 
 		 658 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.45 
 
 		 714 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  34.12 
 
 		 665 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  41.57 
 
 		 679 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  38.52 
 
 		 695 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.38 
 
 		 513 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.31 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  39.62 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.04 
 
 		 684 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  39.51 
 
 		 671 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  39.51 
 
 		 525 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  39.51 
 
 		 671 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  39.51 
 
 		 525 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  39.51 
 
 		 671 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.51 
 
 		 578 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.51 
 
 		 578 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  38.91 
 
 		 616 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  33.56 
 
 		 645 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  33.56 
 
 		 642 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.58 
 
 		 685 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  37.31 
 
 		 676 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.62 
 
 		 671 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 747 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  34.33 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  34.43 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>