123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4179 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4179  Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase  100 
 
 
847 aa  1731    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4177  hypothetical protein  46.3 
 
 
369 aa  321  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
291 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
841 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
311 aa  72  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
525 aa  65.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1340 aa  64.3  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
753 aa  63.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
1162 aa  62.4  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.96 
 
 
2401 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
340 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
619 aa  57.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
884 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 
298 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
270 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
379 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
329 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  25.37 
 
 
291 aa  53.9  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.79 
 
 
408 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
322 aa  54.3  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
361 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
300 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
289 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
338 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
341 aa  52  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
289 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1537  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
312 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
785 aa  52  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
311 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.4 
 
 
338 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
280 aa  51.6  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0422  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
515 aa  51.6  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
345 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  32.32 
 
 
474 aa  51.2  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  24.01 
 
 
335 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.98 
 
 
242 aa  51.2  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
340 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
350 aa  50.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1624  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
272 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
528 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
272 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3188  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
272 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1400  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
272 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2650  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
272 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  21.99 
 
 
316 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1967  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.27 
 
 
272 aa  50.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
313 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
891 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2511  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 
272 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2564  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
272 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0559  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 
515 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
317 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
339 aa  49.3  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
379 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
264 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
279 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
304 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
294 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.85 
 
 
325 aa  48.9  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
328 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
282 aa  48.5  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0561  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 
526 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4815  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 
515 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
460 aa  48.5  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 
310 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
312 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
294 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
327 aa  48.5  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
247 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
994 aa  48.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
308 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.26 
 
 
309 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
455 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
317 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1051  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 
618 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 
346 aa  47.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2725  putative glucosyltransferase  26.29 
 
 
302 aa  47.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
291 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
323 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  23.87 
 
 
310 aa  47  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
226 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
294 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  39.19 
 
 
738 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
311 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
413 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 
310 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.57 
 
 
515 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
294 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  33 
 
 
848 aa  45.8  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
237 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
1035 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 
310 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  25.87 
 
 
664 aa  45.8  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
412 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
924 aa  45.8  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
303 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
342 aa  45.8  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.68 
 
 
1115 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 
313 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>