100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1165 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  89.2 
 
 
283 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  88.85 
 
 
290 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  66.43 
 
 
283 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  49.82 
 
 
294 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  43.06 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 
313 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  42.36 
 
 
315 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  44.71 
 
 
664 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  46.64 
 
 
296 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  46.1 
 
 
284 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  41.82 
 
 
275 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
288 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  46.15 
 
 
283 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  42.2 
 
 
301 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  40.7 
 
 
300 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  28.14 
 
 
327 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
525 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
425 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
891 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  26.64 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.91 
 
 
1225 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
884 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
419 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
413 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.94 
 
 
2401 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  25.63 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  31.58 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
836 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
352 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
841 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
619 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
328 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
513 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.06 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  34.16 
 
 
461 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
773 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
345 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.84 
 
 
754 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
703 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  34.43 
 
 
498 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
455 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  38.98 
 
 
474 aa  46.2  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.95 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
742 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.79 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.11 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.63 
 
 
312 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
994 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.51 
 
 
427 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
1268 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
683 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
983 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 
824 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
1077 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  22.4 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
477 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  32.47 
 
 
333 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 
1739 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
307 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
742 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
487 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
742 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
623 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.88 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4179  Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase  27.88 
 
 
847 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
597 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
421 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>