130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1389 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
283 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  98.94 
 
 
290 aa  553  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  88.85 
 
 
287 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  64.54 
 
 
283 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
313 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  42.46 
 
 
313 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  50 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  46.64 
 
 
664 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
315 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  47.14 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  47.31 
 
 
284 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  42.03 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  42.71 
 
 
288 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  50.72 
 
 
283 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  39.29 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  39.07 
 
 
300 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  28.08 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  27.5 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
525 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
333 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
425 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
280 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
884 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
619 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
891 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.7 
 
 
1225 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
419 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  30.86 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
841 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  29.23 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
302 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
513 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.39 
 
 
2401 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.01 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
477 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
455 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
773 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
413 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  33.5 
 
 
461 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
352 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
691 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.58 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
742 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.39 
 
 
754 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  37.02 
 
 
474 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
824 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
623 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  30.37 
 
 
321 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.31 
 
 
499 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
345 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
691 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 
841 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
691 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
742 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
836 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
322 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
325 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.53 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  32.34 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
994 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2635  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.448186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
1267 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
742 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
683 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.4 
 
 
792 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4179  Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase  27.05 
 
 
847 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 
405 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  24.26 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
834 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  31.88 
 
 
561 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
703 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
460 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 
1077 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
341 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>