21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4443 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  100 
 
 		 301 aa  593  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  50.69 
 
 		 275 aa  262  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  49.49 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  49.32 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  48.76 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  41.08 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  40 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  41.28 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  35.91 
 
 		 664 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  25.68 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 425 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 1737 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 405 aa  42.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>