40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3363 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  47.81 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  46.92 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  51.1 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  49.32 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  43.9 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  43.9 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  41.57 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  40.67 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  39.86 
 
 		 664 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  39.72 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  42.71 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  43.18 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  42.81 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  26.41 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  34.5 
 
 		 474 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  21.33 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.87 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  25.88 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 684 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 513 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  31.98 
 
 		 501 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  25.38 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 		 336 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>