174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3483 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  72.89 
 
 		 163 aa  227  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  72.89 
 
 		 163 aa  227  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  79.33 
 
 		 163 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  78.23 
 
 		 153 aa  217  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  70 
 
 		 168 aa  213  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  60.76 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  72.19 
 
 		 160 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  72.19 
 
 		 160 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  51.85 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  51.85 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  52.17 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  54.43 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  58.99 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  54.55 
 
 		 158 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  54.09 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  52.9 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  50.32 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  49.4 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  52 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  51.53 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  49.03 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  52.48 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  53.9 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  50.34 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  51.16 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  43.12 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  42.31 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  35.58 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  40.4 
 
 		 215 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  38.65 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  41.36 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  39.51 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  39.51 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  47.76 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  38.61 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  37.42 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  39.53 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  35.85 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  41.13 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  41.13 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  38.24 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  38.16 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  38.22 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  35.85 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  37.31 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  36.77 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  37.31 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  37.31 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  36.15 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  32.34 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  36.25 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  38.06 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  35.98 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  37.31 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  34.9 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  36.29 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  35.9 
 
 		 164 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  35.9 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  35.94 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  37.59 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  36.51 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  35.88 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  32.86 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  34.42 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  36.64 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  33.59 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  34.43 
 
 		 155 aa  94.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  32.68 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  34.33 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  33.59 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  30.6 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  30.92 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  34.92 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  35.34 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  34.59 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  33.87 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  35 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  32.03 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  34.88 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  33.05 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>