174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4266 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  97.5 
 
 		 160 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  84.56 
 
 		 153 aa  243  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  79.22 
 
 		 168 aa  238  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  74.68 
 
 		 163 aa  223  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  72.61 
 
 		 163 aa  221  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  72.61 
 
 		 163 aa  221  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  70.51 
 
 		 168 aa  210  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  56.95 
 
 		 159 aa  197  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  50.62 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  52.53 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  52.53 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  54.72 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  53.59 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  56.41 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  51.3 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  51.97 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  52.63 
 
 		 158 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  54.86 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  50.33 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  49.36 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  50.34 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  57.24 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  51.27 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  51.3 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  51.61 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  49.26 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  47.95 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  44.3 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  42.42 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  47.95 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  40.38 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  40.49 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  40.61 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  44.53 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  40.61 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  40.25 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  39.72 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  43.7 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  41.91 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  37.76 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  35.48 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  37.41 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  36.6 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  36.11 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  37.33 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  35.51 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  37.41 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  40.26 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  37.58 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  38.61 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  35.71 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  37.9 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  35.33 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  37.9 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  35.51 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  36.96 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  37.31 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  36.92 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  34.72 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  35.9 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  35.07 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  36.36 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  37.34 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  36.88 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  31.17 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  36.2 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  31.29 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  37.12 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  34.46 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  33.54 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  33.54 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  33.54 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  34.38 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  34.31 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  34.57 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  30.91 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  34.46 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  32.7 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  33.78 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  34.09 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  32.85 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>