173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2015 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  100 
 
 		 172 aa  344  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  66.42 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  57.05 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  47.71 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  48.05 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  47.71 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  48.59 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  46.85 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  46.38 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  46.21 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  40.82 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  47.92 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  44.51 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  42.96 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  46.04 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  46.05 
 
 		 168 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  46.32 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  45.59 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  45.59 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  46.9 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  47.79 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  44.76 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  39.16 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  41.18 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  40.12 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  39.86 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  37.74 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  40.43 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  42.95 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  41.77 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  34.09 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  35.57 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  41.45 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  42.14 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  37.76 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  40.51 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  39.1 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  35.19 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  35.19 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  34.57 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  39.19 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  39.16 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  37.18 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  38.57 
 
 		 157 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  38.64 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  38.64 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  38.64 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  37.78 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  37.76 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  39.72 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  38.64 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  40.3 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  36.24 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  35.66 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  35.57 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  37.88 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  37.88 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  38.85 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  38.16 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  33.54 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  33.54 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  36.81 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  37.59 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  37.91 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  39.42 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  39.23 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  38.84 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  42.22 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  42.22 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  38.17 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>