173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2979 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  100 
 
 
172 aa  340  5e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  55.26 
 
 
157 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  52.56 
 
 
159 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  54.61 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  53.25 
 
 
158 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 
159 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  53.59 
 
 
164 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  56.25 
 
 
168 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  54.73 
 
 
162 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  48.72 
 
 
164 aa  157  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  43.42 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  47.97 
 
 
160 aa  153  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  45.28 
 
 
166 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  47.86 
 
 
161 aa  151  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  47.8 
 
 
163 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  47.8 
 
 
163 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  49.66 
 
 
163 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  44.72 
 
 
168 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  44.72 
 
 
168 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  49.39 
 
 
168 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  49.66 
 
 
156 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  50.34 
 
 
215 aa  147  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 
153 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  49.35 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
166 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  43.12 
 
 
166 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  47.02 
 
 
166 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  45.06 
 
 
168 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  47.31 
 
 
175 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  44.16 
 
 
177 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  50.36 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  47.13 
 
 
160 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  43.75 
 
 
172 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  48.61 
 
 
166 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  42.42 
 
 
164 aa  133  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  46.38 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  45.99 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  40.15 
 
 
171 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  45.33 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  40.15 
 
 
157 aa  114  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  40.99 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  40.15 
 
 
152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  38.32 
 
 
167 aa  106  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  35.06 
 
 
173 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  35.63 
 
 
177 aa  105  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 
172 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  33.12 
 
 
164 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  35.22 
 
 
175 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  37.23 
 
 
154 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  36.91 
 
 
164 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  35.81 
 
 
169 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  38.82 
 
 
161 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  35.48 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  34.19 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  33.57 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  37.04 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  31.48 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  34.39 
 
 
164 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  32.39 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  33.76 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  36.88 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  30.32 
 
 
188 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  33.57 
 
 
157 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  36.69 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  35.26 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  40.32 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  35.26 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  40.32 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  31.43 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  35.26 
 
 
161 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  32.37 
 
 
153 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  29.81 
 
 
174 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  32.61 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  32.45 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  32.86 
 
 
156 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  32.67 
 
 
166 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  34.33 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  32.17 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 
148 aa  91.3  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  32.82 
 
 
155 aa  91.3  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.191942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  34.53 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.738209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>