174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0116 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  83.65 
 
 		 159 aa  278  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  78.62 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  77.99 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  77.36 
 
 		 157 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  79.47 
 
 		 164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  74.84 
 
 		 162 aa  245  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  58.49 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  59.87 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  60.27 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  60.27 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  53.59 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  56.49 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  57.5 
 
 		 168 aa  180  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  61.65 
 
 		 168 aa  173  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  54.05 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  54.42 
 
 		 172 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  54.19 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  56.29 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  52.78 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  56.29 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  55.56 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  55.48 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  52.94 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  53.15 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  52.9 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  50 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  41.88 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  41.88 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  41.88 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  46.32 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  40.27 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  41.5 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  43.07 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  39.61 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  42.45 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  41.73 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  44.53 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  38.97 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  41.45 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  41.89 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  44.35 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  44.35 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  34.39 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  38.75 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  38.31 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  37.89 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  39.1 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  38.81 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  40.15 
 
 		 160 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  36.53 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  38.81 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  39.69 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  37.06 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  37.76 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  37.88 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  31.01 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  37.68 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  36.76 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  35 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  36.69 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  39.39 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  36.64 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  35.66 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  38.24 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  34.51 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  35.61 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  34.19 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  34.19 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  36.17 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  34.75 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  34.31 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  35.46 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  32.72 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  34.19 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  37.23 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  35.2 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  33.09 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  31.61 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  33.58 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  35.11 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  34.19 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  35.92 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2825  preprotein translocase subunit SecB  36.22 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  35.38 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>