175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4363 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 158 aa  327  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  98.73 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  93.67 
 
 		 158 aa  308  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  93.67 
 
 		 158 aa  308  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  93.67 
 
 		 158 aa  308  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  92.41 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 155 aa  297  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  88.61 
 
 		 155 aa  297  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  87.97 
 
 		 179 aa  287  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  86.08 
 
 		 158 aa  285  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 		 159 aa  226  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  72.11 
 
 		 161 aa  223  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  71.53 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  72.54 
 
 		 161 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  73.88 
 
 		 160 aa  218  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  70.07 
 
 		 163 aa  218  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  71.83 
 
 		 161 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  71.83 
 
 		 161 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  71.83 
 
 		 161 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  70.07 
 
 		 162 aa  217  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  71.13 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  68.71 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  74.81 
 
 		 154 aa  213  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  72.79 
 
 		 164 aa  213  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  74.05 
 
 		 161 aa  213  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  74.07 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  73.33 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  73.33 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  73.33 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2227  preprotein translocase subunit SecB  71.74 
 
 		 154 aa  210  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0081632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  62.84 
 
 		 169 aa  209  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  65 
 
 		 155 aa  207  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  61.69 
 
 		 169 aa  202  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  59.24 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  58.9 
 
 		 171 aa  198  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  55.32 
 
 		 165 aa  184  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  53.09 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  52.6 
 
 		 161 aa  176  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  57.66 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  57.66 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  57.43 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  57.43 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  54.01 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  54.01 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  54.01 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  50.97 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  54.01 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  48.43 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  54.29 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  54.29 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  53.03 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  49.66 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  50.72 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  55.56 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  56.83 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  56.83 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  48.59 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  51.47 
 
 		 188 aa  153  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  53.28 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  55.74 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  52.94 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  48.05 
 
 		 168 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  45.86 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  43.15 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  44.37 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  44.37 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  44.37 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  44.29 
 
 		 172 aa  136  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  41.4 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  45.52 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  42.07 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  41.94 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  45.89 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  41.29 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  44.88 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  50.36 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  50.36 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  44.19 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  41.61 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  41.61 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>