174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2784 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  70.51 
 
 		 166 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  64.94 
 
 		 175 aa  237  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  69.23 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  64.05 
 
 		 164 aa  214  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  61.48 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  61.19 
 
 		 171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  43.71 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  42.01 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  41.92 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  44.52 
 
 		 157 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  47.83 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  44.22 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  46.91 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  44.83 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  43.29 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  43.12 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  40.48 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  45.22 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  41.96 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  41.46 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  41.06 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  41.98 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  41.98 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  42.95 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  41.5 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  44 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  40.12 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  40.14 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  40.49 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  39.63 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  38.61 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  37.97 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  37.97 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  36.59 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  37.8 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  38.57 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  39.29 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  36.84 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  34.76 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  30.23 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  36.25 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  33.1 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  31.43 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  38.69 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  31.43 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  32.12 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  30.81 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  29.89 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  30.68 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  37.09 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  33.81 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  30.92 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  30.49 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  36.42 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  36.5 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  34.69 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  36.5 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  32.22 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  33.83 
 
 		 150 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 		 155 aa  84.3  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  34.19 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  34.44 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  34.21 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  30.52 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  31.36 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  35 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  32.9 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  35.97 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  33.94 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  33.58 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  31.94 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  33.86 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  36.81 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  33.55 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  35.82 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  33.55 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  33.55 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  35.29 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  29.2 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  34.21 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  31.93 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>