175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3422 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 157 aa  320  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  46.94 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  43.7 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  42.66 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  42.65 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  42.65 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  40.58 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  42.86 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  40.26 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  40.65 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  42.14 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  38.16 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  42.14 
 
 		 179 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  37.58 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  41.55 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  42.25 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  42.96 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  38.62 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  40.4 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  41.91 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  41.91 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 188 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  41.91 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  39.73 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  38.16 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  41.48 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  40.14 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  43.51 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  43.51 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  40.14 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  40.14 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  40.14 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  40.14 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  38.41 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  40.85 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  39.31 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  36.08 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  38.3 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  37.58 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  37.58 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  36.77 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  38.26 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  39.44 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  36.49 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  35.33 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  41.18 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  37.58 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  35.62 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  35.62 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  40.38 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  37.06 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  36.42 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  40.38 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  36.55 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  39.44 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  38.56 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  36.91 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  40.15 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  35.57 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  36.17 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  39.44 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  39.44 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  39.44 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  38.13 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  36.3 
 
 		 215 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  38.97 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  35.57 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  36.08 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  37.14 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  35.76 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  35.57 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  36.08 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  35.33 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  36.91 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  36.91 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  38.19 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  39.24 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  36.62 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  40.48 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>