174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0193 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  61.88 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 172 aa  204  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  59.28 
 
 		 166 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  59.88 
 
 		 166 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  59.88 
 
 		 175 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  57.8 
 
 		 177 aa  197  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  44.72 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  45.34 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  45.4 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  47.4 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  45.4 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  44.72 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  43.64 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  43.05 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  41.84 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  41.36 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  40.12 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  40.12 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  41.98 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  40.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  39.76 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  41.4 
 
 		 156 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  40.65 
 
 		 172 aa  124  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  38.65 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  41.67 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  39.46 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  36.97 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  33.73 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  41.25 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  37.06 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  37.06 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  37.06 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  40.72 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  40 
 
 		 215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  37.58 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  33.54 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  35.84 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  38.81 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  36 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  35.92 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  29.93 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  32.54 
 
 		 177 aa  94  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  33.58 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  32.12 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  32.3 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  29.93 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  33.55 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  34.31 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  32.3 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  30.82 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  31.58 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  28.76 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  30.2 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  32.64 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  34.07 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  33.78 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  34.07 
 
 		 159 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  34.07 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  30.52 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  34.07 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  34.07 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  29.52 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  34.07 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  30.06 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  30.53 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  32.65 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  32.37 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  30.06 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  33.1 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  29.63 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  32.12 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  31.72 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  29.63 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  32.12 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  33.1 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3502  preprotein translocase subunit SecB  29.85 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2825  preprotein translocase subunit SecB  29.85 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  32.85 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0940  protein-export protein SecB  31.33 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.743949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  31.82 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  27.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  33.09 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  31.51 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  30.36 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  28.92 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  28.65 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  28.65 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  31.21 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  30.64 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>