173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3829 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  57.05 
 
 		 172 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  53.85 
 
 		 156 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  51.82 
 
 		 158 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 159 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 159 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  50.67 
 
 		 157 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  50.36 
 
 		 162 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  51.82 
 
 		 158 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  52.21 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  48.23 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  48.91 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  51.41 
 
 		 168 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  43.05 
 
 		 159 aa  138  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  45.75 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  47.83 
 
 		 168 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  47.83 
 
 		 168 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  47.41 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  45.58 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  46.48 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  41.28 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  43.66 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  40.25 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  42.96 
 
 		 168 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  40.76 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  40.76 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  42.97 
 
 		 152 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  40.38 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  40.76 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  40.38 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  43.62 
 
 		 153 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  40.4 
 
 		 168 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  40.23 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  42.48 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  39.35 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  42.48 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  40.13 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  41.88 
 
 		 164 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  44.72 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  44.72 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  36.54 
 
 		 159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  42.31 
 
 		 155 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  38.57 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  40.3 
 
 		 164 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  40.44 
 
 		 171 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  36.92 
 
 		 157 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  36.81 
 
 		 171 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  38.01 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 155 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  33.95 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 155 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 155 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 155 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 155 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  37.27 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  38.28 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  37.21 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  37.21 
 
 		 156 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 157 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  37.21 
 
 		 156 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 155 aa  104  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  36.62 
 
 		 159 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  35.4 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  38.62 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  34.18 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  37.84 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  36.55 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  34.03 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  35.42 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  36.09 
 
 		 164 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  34.03 
 
 		 163 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  36.31 
 
 		 163 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  35.51 
 
 		 162 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  36.31 
 
 		 163 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  36.24 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  34.97 
 
 		 164 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  35.95 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  36.17 
 
 		 159 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  38.28 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>