174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0930 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  86.45 
 
 		 150 aa  278  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  78.17 
 
 		 152 aa  234  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  84.92 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  74.34 
 
 		 167 aa  225  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  72.79 
 
 		 155 aa  220  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2825  preprotein translocase subunit SecB  77.27 
 
 		 150 aa  214  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3502  preprotein translocase subunit SecB  77.27 
 
 		 150 aa  214  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0041  preprotein translocase subunit SecB  74.81 
 
 		 169 aa  215  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  69.34 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  69.63 
 
 		 172 aa  199  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  69.63 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  69.63 
 
 		 173 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  59.06 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  60.56 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  59.86 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  61.27 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  58.28 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  58.99 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0940  protein-export protein SecB  57.64 
 
 		 181 aa  178  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.743949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  55.47 
 
 		 174 aa  173  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  52.94 
 
 		 173 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0254  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 172 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0307  preprotein translocase subunit SecB  62.12 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  47.65 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  45.39 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  44.96 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  46.9 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  46.38 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  42.95 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  40.41 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  45.38 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  45.38 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  39.04 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  40.41 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  41.79 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  41.04 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  40.91 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  38.73 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  40.15 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  37.75 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  37.75 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  37.32 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  44.44 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  37.06 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  37.98 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  36.13 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  37.93 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  36.43 
 
 		 179 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  40.6 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  40.6 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  38.62 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  38.62 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  36.84 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  35.17 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  36.18 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  37.41 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  38.93 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  37.8 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  37.8 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  35.46 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  37.78 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  32.62 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  37.4 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  37.98 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  38.17 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  36.18 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  38.17 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>