175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4026 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  96.77 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  96.13 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  94.84 
 
 		 155 aa  313  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  90.38 
 
 		 156 aa  299  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  90.51 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  90.51 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  89.24 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  90.51 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  89.74 
 
 		 156 aa  295  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  88.44 
 
 		 179 aa  285  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  84.42 
 
 		 158 aa  279  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  72.85 
 
 		 159 aa  227  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  72.79 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  76.06 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  72.92 
 
 		 162 aa  222  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  73.94 
 
 		 161 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  70.75 
 
 		 163 aa  220  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  73.72 
 
 		 162 aa  220  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  70.07 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2227  preprotein translocase subunit SecB  76.12 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0081632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  77.04 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  75 
 
 		 164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  76.3 
 
 		 161 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  76.3 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  76.3 
 
 		 161 aa  214  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  72.39 
 
 		 160 aa  213  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  74.05 
 
 		 154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  73.28 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  63.95 
 
 		 169 aa  208  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  64.79 
 
 		 155 aa  208  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  62.34 
 
 		 169 aa  203  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  60.65 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  59.06 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  55.32 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  59.71 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  59.71 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  54.49 
 
 		 161 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  55.71 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  55.71 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  54.11 
 
 		 163 aa  173  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  55.71 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  56.12 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  58.74 
 
 		 162 aa  170  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  58.74 
 
 		 162 aa  170  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  51.72 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  53.96 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  53.96 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  46.95 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  51.45 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  53.62 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  55.56 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  53.33 
 
 		 188 aa  156  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  51.7 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  52.83 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  52.83 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  47.62 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  54.55 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  48.72 
 
 		 168 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  45.81 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  53.68 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 172 aa  140  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  44.14 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  45.45 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  46.72 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  45.45 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  47.06 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  43.54 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  42.04 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  42.86 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  44.03 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  46.51 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  48.92 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  48.92 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  42.34 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>