174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1312 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  79.17 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  75.5 
 
 		 167 aa  231  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  84.21 
 
 		 154 aa  230  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  72.3 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0041  preprotein translocase subunit SecB  78.68 
 
 		 169 aa  226  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  74.83 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3502  preprotein translocase subunit SecB  81.25 
 
 		 150 aa  219  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2825  preprotein translocase subunit SecB  81.25 
 
 		 150 aa  219  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  69.34 
 
 		 166 aa  199  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  64.19 
 
 		 153 aa  197  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  63.09 
 
 		 172 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  63.64 
 
 		 173 aa  190  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  63.64 
 
 		 172 aa  190  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  56.49 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  55.77 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  60.43 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  55.13 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0940  protein-export protein SecB  58.44 
 
 		 181 aa  186  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.743949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 160 aa  186  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  60.58 
 
 		 159 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  57.89 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  56.67 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0254  preprotein translocase subunit SecB  59.86 
 
 		 172 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  55.97 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0307  preprotein translocase subunit SecB  60.42 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  49.03 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  48.67 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  48.89 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  51.77 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  47.18 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  43.04 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  44.14 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  45.19 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  45.19 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  44.88 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  42.14 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  43.97 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  43.97 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  43.97 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  41.96 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  41.96 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  43.97 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  43.97 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  43.97 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  43.38 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  43.26 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  41.13 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  41.13 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  40.56 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  40.56 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  39.86 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  40.56 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  44.03 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  44.03 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  44.03 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  40.56 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  40.56 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  44.03 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  37.93 
 
 		 169 aa  120  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  41.3 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  41.67 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  42.64 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  38.99 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  32.62 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  36.55 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  36 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  37.42 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  36 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  37.76 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  39.33 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  41.48 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  37.74 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  37.24 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  37.24 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  36.55 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  45.6 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>