174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2857 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  66.88 
 
 		 166 aa  223  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  66.88 
 
 		 175 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  64.97 
 
 		 166 aa  220  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  64.05 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  67.91 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  62.84 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  46.1 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  47.06 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  46.05 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  46.85 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  43.75 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  44.74 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  45.16 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  39.88 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  44.22 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  44.1 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  42.86 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  42.86 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  43.12 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  39.61 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  42.95 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  38.96 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  38.36 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  40.13 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  42.42 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  34.76 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  42.14 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  35.4 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  35.4 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  36.02 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  40.69 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  38.13 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  41.88 
 
 		 215 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  36.31 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  40.77 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  40.52 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  33.76 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  33.11 
 
 		 171 aa  94  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  31.72 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  34.73 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  34.78 
 
 		 164 aa  91.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  35.48 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  33.93 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  33.55 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  30.66 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  30.25 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  30.2 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  36.13 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  34.9 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  33.58 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  29.68 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  33.96 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  32.35 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  34.87 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  34.53 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  31.88 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  36.05 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  32.59 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  34.51 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  31.82 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  32.9 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  34.51 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  34.51 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  32.24 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  34.59 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  32.24 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  34.51 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  30.72 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  33.56 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  35.71 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  33.87 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  31.62 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  34.69 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  32.35 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  33.78 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  32.26 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  34.69 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>