174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4243 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  86.08 
 
 		 161 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  86.71 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  86.71 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  85.35 
 
 		 164 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  85.99 
 
 		 161 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  85.99 
 
 		 161 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  83.44 
 
 		 162 aa  278  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  81.65 
 
 		 163 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  81.65 
 
 		 163 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  79.5 
 
 		 163 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  60.13 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  59.73 
 
 		 165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  60.13 
 
 		 163 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  62.59 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  58.82 
 
 		 157 aa  193  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  57.32 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  59.48 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  58.82 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  58.17 
 
 		 161 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  58.17 
 
 		 161 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  58.17 
 
 		 161 aa  190  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  60.69 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  57.52 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  53.79 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  60 
 
 		 157 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  57.75 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  59.31 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  59.31 
 
 		 161 aa  183  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  59.31 
 
 		 161 aa  183  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  57.34 
 
 		 156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  54.04 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  54.37 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  53.09 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  57.04 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  53.8 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  54.05 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  53.5 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  53.5 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  53.5 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  56.03 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  53.16 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2227  preprotein translocase subunit SecB  59.12 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0081632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  55.24 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  58.16 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  55.71 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  51.66 
 
 		 165 aa  170  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  56.34 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  52.7 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  50.97 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  53.16 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  53.16 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  49.32 
 
 		 188 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  45.22 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  54.55 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  48.94 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  47.24 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  56.72 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  56.72 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  48.89 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  44.08 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  51.91 
 
 		 151 aa  147  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  43.12 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  46.45 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  45.27 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  41.98 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  41.98 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  44.22 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  46.58 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  45.52 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  42.96 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  40.52 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  38.52 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  46.67 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  41.43 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  46.67 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  42.36 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  41.43 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  42.66 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  39.55 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>