174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1788 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 166 aa  337  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  54.36 
 
 		 171 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  45.28 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  48.92 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  46.53 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  45.28 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  45.57 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  48.65 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  42.45 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  46.04 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  45.34 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  45.81 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  44.3 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  44.3 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  41.13 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  41.13 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  41.13 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  41.22 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  43.87 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  43.87 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  43.87 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  42.31 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  42.59 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  39.87 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  38.22 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  36.6 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  42.57 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  43.57 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  39.35 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  37.58 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  40.43 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  37.91 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  41.51 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  39.13 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  37.27 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  36.84 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  37.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  33.76 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  33.33 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  35.37 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  35.8 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  35.86 
 
 		 172 aa  97.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  36.42 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  33.11 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  33.55 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  34.59 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  32.3 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  33.74 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  33.96 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  34.78 
 
 		 157 aa  94.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  37.84 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  35.44 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  35.44 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  33.13 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  35.37 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  34.03 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  32.67 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  34.9 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  33.74 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  33.56 
 
 		 164 aa  91.3  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  35.03 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  32.39 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  36.18 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  35.58 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  37.06 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>