174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1237 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 175 aa  360  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  96.99 
 
 		 166 aa  337  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  64.94 
 
 		 177 aa  237  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  66.88 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  64.71 
 
 		 172 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  63.97 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  49.04 
 
 		 158 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  48.17 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  49.39 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  47.2 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  44.38 
 
 		 159 aa  151  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  45.16 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  46.01 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  41.88 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  44.83 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  44.94 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  46.84 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  42.01 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  48.37 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  43.21 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  41.89 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  43.04 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  44.65 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  43.04 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  42.59 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  43.87 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  42.95 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  40.61 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  40.61 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  44.29 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  40.23 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  36.26 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  38.56 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  37.74 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  39.51 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  38.41 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  38.41 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  41.33 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  35.34 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  34.42 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  31.95 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  34.72 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  32.34 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  35.21 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  34.75 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  32.54 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  35.51 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  37.01 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  32.35 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  34.04 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  33.57 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  32.7 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  32.86 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  31.48 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  32.5 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  35.8 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  32.89 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  29.29 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  33.61 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  39.19 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  32.12 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  32.28 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  33.8 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  34.19 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  32.48 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  35.83 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  35.76 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  34.93 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  30.19 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  29.7 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  29.7 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  34 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  36.97 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  36.97 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  31.51 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  30.49 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>