174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2072 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  98.16 
 
 		 163 aa  330  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  72.89 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  75.48 
 
 		 168 aa  226  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  72.61 
 
 		 160 aa  220  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  72.61 
 
 		 160 aa  220  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  78 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  62.03 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  55.77 
 
 		 162 aa  193  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  57.67 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  57.67 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  58.75 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  55.92 
 
 		 158 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  56.05 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  56.29 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  54.3 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  56.69 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  55.7 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  53.64 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  54.94 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  54.84 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  55.63 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  58.9 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  53.59 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  48.41 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  49.66 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  45.52 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  40.76 
 
 		 215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  43.87 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  35.19 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  38.85 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  40.4 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  40.76 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  38.41 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  38.41 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  41.91 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  44.74 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  38.89 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  39.31 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  37.18 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  41.94 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  41.94 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  35.71 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  35.66 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  38.51 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  34.87 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  34.78 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  35.5 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  35.14 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  36.5 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  35.77 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  36.64 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  33.57 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  31.72 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  35.77 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  33.1 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  32.39 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  36.57 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  34.18 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  35.82 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  31.72 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  32.69 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  31.03 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  33.78 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  32.24 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  34.38 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  34.27 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  30.34 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  31.21 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  33.57 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  32.52 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  35.61 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  33.59 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  34.38 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  35.61 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  35.61 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  35.48 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  33.12 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  35.61 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  35.61 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  31.9 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  34.75 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  35.61 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  32.21 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  32.35 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>