174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0289 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  54.36 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  46.58 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  38.46 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  36.99 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  36.26 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  36.26 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  40.88 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  43.17 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  37.43 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  37.28 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  37.28 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  39.26 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  38.03 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  41.73 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  39.71 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  41.26 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  40.56 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  41.01 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  34.76 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  37.82 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  38.35 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  37.76 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  38.26 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  32.67 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  36.84 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  40.91 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  39.22 
 
 		 153 aa  94.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  40.26 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  39.1 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  33.11 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  39.42 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  40.85 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  37.76 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  35.22 
 
 		 215 aa  91.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  37.23 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  34.78 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  34.78 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  34.78 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  37.04 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  37.67 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  31.76 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  32.52 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  36.77 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  34.44 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  32.59 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  31.33 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  34.85 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  30.95 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  31.29 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  34.38 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  30.95 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  35.17 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  31.88 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  31.88 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  32.88 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  27.49 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  32.1 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  30.87 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  30.87 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  34.06 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  33.57 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  34.06 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  34.06 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  34.06 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  34.06 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  34.06 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  28.3 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  25.61 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  34.29 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  32.86 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  28.57 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  28.57 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  28.79 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  28.26 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  32.14 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  32.14 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  32.14 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  27.5 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0497  protein translocase subunit secB  32.58 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  25.93 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  27.22 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  28.03 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  28.26 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  28.48 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  26 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  27.71 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  27.27 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  28.79 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>