More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf295 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf295  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  716    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.410445  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51.05 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 357 aa  348  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.14 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.14 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 359 aa  335  7e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.34 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0003  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  45.07 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  45.81 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  45.81 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  45.07 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  45.58 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 361 aa  329  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 358 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  48.64 
 
 		 361 aa  325  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 355 aa  325  6e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 359 aa  325  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  44.35 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  48.13 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.14 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  45.03 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  44.79 
 
 		 357 aa  322  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  44.67 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  48.82 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  43.66 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  44.82 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  50.88 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  46.57 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  45.25 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  49.24 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 355 aa  318  6e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  45.04 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  43.94 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  44.17 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  44.67 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  47.02 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  47.55 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  47.02 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  43.89 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 364 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  44.17 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  44.99 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  47.02 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  47.13 
 
 		 363 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  46.92 
 
 		 372 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 359 aa  315  6e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  46.47 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  47.55 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  47.55 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  45.1 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  43.26 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>