More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0003 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0003  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  740    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  57.68 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  60.75 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  49.4 
 
 		 362 aa  362  8e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 367 aa  359  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  53.47 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.7 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  53.47 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  51.38 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 358 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  54.58 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  51.5 
 
 		 355 aa  348  9e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  57.84 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  54.69 
 
 		 356 aa  346  5e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 360 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  46.8 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  49.55 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 360 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  51.1 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  49.24 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  49.39 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 359 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  50.3 
 
 		 359 aa  338  8e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.84 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.78 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  48.78 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  48.94 
 
 		 356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.25 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.88 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  49.11 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.65 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 358 aa  332  8e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.65 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  45.92 
 
 		 360 aa  331  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  52.08 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  48.94 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 		 358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 362 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 362 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 361 aa  328  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  48.8 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  49.86 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  46.72 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 355 aa  325  5e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 354 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>