More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3857 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  54.15 
 
 
277 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211882  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
279 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.853337  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 
275 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109992  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.86 
 
 
406 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
420 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193876  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  42.59 
 
 
422 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
423 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
424 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
418 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
418 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
418 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
420 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156739  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
420 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
413 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2168  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
418 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0193763  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 
415 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0644  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 
419 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
446 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0108621  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
420 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
418 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.74 
 
 
303 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
425 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.653272  normal  0.230244 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  37.5 
 
 
426 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
588 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0237049  normal  0.467133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
462 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  36.39 
 
 
297 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
423 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.33 
 
 
415 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  36.3 
 
 
297 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0564  polyamine ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 
415 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
422 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.633443  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
416 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  37.61 
 
 
417 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
301 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
422 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030853  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
301 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5123  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.8 
 
 
415 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0230497  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
417 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  41.87 
 
 
392 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
415 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.966966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
421 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  41.18 
 
 
412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
297 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
309 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
422 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
323 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
422 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
415 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
415 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
294 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  40.54 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
309 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
303 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0381119  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1732  transport system permease transmembrane protein  41.27 
 
 
420 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0286401  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
309 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
541 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
324 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
293 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
295 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
416 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
308 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  41.82 
 
 
326 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  41.36 
 
 
326 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  41.92 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  41.82 
 
 
326 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
391 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
283 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153195  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
328 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
328 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
323 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  41.36 
 
 
326 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
278 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
328 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
331 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
285 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
309 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>