More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1859 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1859  transcriptional regulator  100 
 
 
463 aa  962    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00497652  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0698  transcriptional regulator  47.28 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0632  psr protein  41.04 
 
 
457 aa  300  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.513825  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  32.12 
 
 
327 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.12 
 
 
327 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  32.08 
 
 
329 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.04 
 
 
294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  29.87 
 
 
473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.16 
 
 
460 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 
377 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.29 
 
 
412 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 
312 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.49 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.28 
 
 
356 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.08 
 
 
353 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.62 
 
 
461 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.46 
 
 
585 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.05 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.93 
 
 
308 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.42 
 
 
505 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.8 
 
 
367 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.67 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  26.98 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.61 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  26.74 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.31 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.26 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.78 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.85 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.5 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  23.94 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  25.95 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.69 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.27 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  28 
 
 
503 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2102  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  30.93 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.246536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.51 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  27.8 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6384  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.64 
 
 
352 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.35 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.57 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.64 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.25 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.66 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  27.34 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  27.56 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  25.34 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  27.34 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  25.08 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.22 
 
 
338 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.13 
 
 
405 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.82 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.58 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  24.56 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  27.08 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  26.53 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.86 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.04 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.91 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  25.88 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.88 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3629  transcription attenuator LytR  27.6 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142384  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.1 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.04 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.74 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.46 
 
 
299 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  28.7 
 
 
386 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.64 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3892  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.5 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.79 
 
 
303 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.29 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  22.97 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.67 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4615  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.27 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4011  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.04 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.66 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  26.84 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  26.84 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  25.9 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  26.84 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  28.87 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.48 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.27 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.48 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.5 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.18 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  28.1 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.1 
 
 
563 aa  70.1  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.16 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.81 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  28.82 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  25 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.41 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  27.11 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.29 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.45 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.29 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>