More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0698 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0698  transcriptional regulator  100 
 
 
476 aa  982    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0632  psr protein  51.23 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.513825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1859  transcriptional regulator  50.64 
 
 
463 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00497652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  32.87 
 
 
329 aa  143  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  33.22 
 
 
327 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.22 
 
 
327 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.89 
 
 
294 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.26 
 
 
377 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.52 
 
 
473 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.62 
 
 
460 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.56 
 
 
356 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.21 
 
 
414 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
353 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.81 
 
 
411 aa  99.8  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 
453 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.87 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2102  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.54 
 
 
327 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.246536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.97 
 
 
585 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.78 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.12 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.61 
 
 
319 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.32 
 
 
302 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.56 
 
 
299 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.36 
 
 
302 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.3 
 
 
340 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.85 
 
 
367 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.72 
 
 
303 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.73 
 
 
394 aa  90.5  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.89 
 
 
414 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.84 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.39 
 
 
308 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.92 
 
 
304 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.32 
 
 
303 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.32 
 
 
303 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.32 
 
 
303 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2557  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 
263 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0157477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  26.61 
 
 
435 aa  87.4  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.75 
 
 
407 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 
445 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.14 
 
 
451 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.57 
 
 
310 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  28.17 
 
 
408 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.39 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.92 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.05 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.02 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.82 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.78 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.5 
 
 
503 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.52 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.76 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.27 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.84 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0598  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.66 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.25 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.12 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.76 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.35 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.1 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.58 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  29.17 
 
 
333 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.97 
 
 
383 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.32 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.77 
 
 
322 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.97 
 
 
505 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  28.15 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  24.84 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  29.17 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.91 
 
 
304 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  29.17 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  29.17 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.73 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.75 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.92 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  28.75 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  28.75 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  28.4 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.45 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  28.4 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  28.4 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.67 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.27 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.14 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  26.4 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  28.63 
 
 
374 aa  77  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.24 
 
 
466 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  27.59 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  27.47 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.35 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  28.02 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  28.02 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.71 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>