More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2794 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 476 aa  976    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.66 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.17 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2557  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.5 
 
 		 263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3892  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0598  cell envelope-related function transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  34.98 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  34.85 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  35.32 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  34.89 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2102  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.73 
 
 		 327 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.246536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.59 
 
 		 330 aa  126  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.48 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  29.17 
 
 		 327 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.17 
 
 		 327 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  28.4 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35.56 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.92 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.44 
 
 		 304 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.36 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.63 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.67 
 
 		 302 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.86 
 
 		 509 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35 
 
 		 302 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.58 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.58 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.24 
 
 		 304 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.04 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.58 
 
 		 311 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.46 
 
 		 374 aa  99  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.88 
 
 		 302 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.93 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.13 
 
 		 516 aa  97.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.16 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.85 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.44 
 
 		 303 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.44 
 
 		 303 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.65 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.44 
 
 		 303 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.85 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.78 
 
 		 299 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.38 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  32.09 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.52 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.21 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 307 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.7 
 
 		 304 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.81 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  33.15 
 
 		 374 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.02 
 
 		 319 aa  93.6  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.82 
 
 		 337 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.58 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  33.15 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.39 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.02 
 
 		 625 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.68 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.68 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.58 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 375 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 375 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.68 
 
 		 333 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  29.89 
 
 		 338 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.44 
 
 		 338 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 296 aa  90.1  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 337 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  30.13 
 
 		 338 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  28.74 
 
 		 337 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0632  psr protein  31 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.513825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  30.57 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.28 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.52 
 
 		 335 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.22 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.742286  normal  0.880699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.68 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  32.98 
 
 		 316 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.74 
 
 		 336 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.96 
 
 		 405 aa  88.6  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.47 
 
 		 310 aa  87.4  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.96 
 
 		 329 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  28 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.11 
 
 		 490 aa  86.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  29.36 
 
 		 333 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.98 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  33.74 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  33.74 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  29.36 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.85 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  33.74 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.71 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>