More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2557 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2557  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.1 
 
 
367 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.5 
 
 
476 aa  221  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  50 
 
 
424 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3892  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.55 
 
 
453 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  35.63 
 
 
340 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0598  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.46 
 
 
337 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.96 
 
 
460 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  32.26 
 
 
329 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.71 
 
 
473 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.28 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 
339 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.4 
 
 
353 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.28 
 
 
405 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2102  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  30.28 
 
 
327 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.246536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  32.09 
 
 
327 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.09 
 
 
327 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.11 
 
 
516 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.79 
 
 
453 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.22 
 
 
304 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.6 
 
 
383 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.82 
 
 
303 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.82 
 
 
303 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.82 
 
 
303 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.67 
 
 
377 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.82 
 
 
302 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.67 
 
 
377 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.36 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.75 
 
 
509 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  32.67 
 
 
374 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  32.67 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  32.67 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  32.67 
 
 
372 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.46 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 
377 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.67 
 
 
375 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 
335 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.94 
 
 
320 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.55 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.38 
 
 
419 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 
333 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 
333 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
333 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
335 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 
333 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  32.58 
 
 
333 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  32.58 
 
 
333 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.68 
 
 
374 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.43 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.85 
 
 
337 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.88 
 
 
394 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.91 
 
 
497 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  32.13 
 
 
335 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  32.13 
 
 
333 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.26 
 
 
349 aa  92.8  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.53 
 
 
411 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.5 
 
 
307 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.07 
 
 
490 aa  92.8  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.11 
 
 
317 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.22 
 
 
333 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.77 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.66 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.03 
 
 
434 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  32.71 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  32.74 
 
 
408 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.69 
 
 
310 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  36.56 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  30.74 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  28 
 
 
445 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.54 
 
 
336 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.15 
 
 
563 aa  90.5  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  30.33 
 
 
338 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.49 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  30.99 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  30.99 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.44 
 
 
414 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.36 
 
 
311 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.36 
 
 
311 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  29.92 
 
 
338 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  29.92 
 
 
333 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  29.92 
 
 
337 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.21 
 
 
531 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  29.67 
 
 
420 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.78 
 
 
393 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.19 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.7 
 
 
495 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0698  transcriptional regulator  31.67 
 
 
476 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.94 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
337 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.12 
 
 
414 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.62 
 
 
451 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.43 
 
 
390 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>