More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3892 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3892  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 453 aa  914    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.4 
 
 		 367 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.43 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.73 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2557  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.55 
 
 		 263 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0157477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  35.47 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0598  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  35.04 
 
 		 340 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2102  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.37 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.246536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.78 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  33.65 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  33.17 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  33.65 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  33.65 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  33.03 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  33.17 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.5 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  33.62 
 
 		 473 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  33.17 
 
 		 374 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  33.17 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.86 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.39 
 
 		 302 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.15 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.82 
 
 		 304 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.07 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.73 
 
 		 302 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.42 
 
 		 308 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.52 
 
 		 303 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.92 
 
 		 303 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.92 
 
 		 303 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1561  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.37 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.16 
 
 		 320 aa  96.7  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.4 
 
 		 443 aa  96.7  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.76 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.52 
 
 		 303 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 296 aa  96.3  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.63 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.71 
 
 		 302 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.03 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  34.03 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.28 
 
 		 563 aa  94  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.39 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.78 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.37 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.32 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.42 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.1 
 
 		 304 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.88 
 
 		 336 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.72 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.82 
 
 		 403 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.33 
 
 		 326 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  32.46 
 
 		 316 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.99 
 
 		 310 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.39 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  28.14 
 
 		 333 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  28.14 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  28.14 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 327 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  28.14 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  28.57 
 
 		 327 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 335 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.71 
 
 		 333 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  30.9 
 
 		 338 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  29.92 
 
 		 338 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  29.92 
 
 		 338 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 		 338 aa  86.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.31 
 
 		 329 aa  86.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  30.9 
 
 		 337 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.67 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.9 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  27.71 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.9 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.29 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.9 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.9 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  27.71 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.28 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.73 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.33 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.33 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.92 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.76 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  27.3 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  31.05 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>