More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4537 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4537  histidine kinase  100 
 
 
626 aa  1233    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0816647  normal  0.123825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  32.51 
 
 
762 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1023 aa  91.3  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
951 aa  90.9  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
880 aa  90.9  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  27.34 
 
 
494 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
758 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
361 aa  89.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.43 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  28.52 
 
 
727 aa  88.2  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  30.08 
 
 
680 aa  87.4  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.2 
 
 
918 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.2 
 
 
918 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.36 
 
 
918 aa  87  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.2 
 
 
918 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.08 
 
 
918 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.2 
 
 
918 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
916 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
717 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  24.81 
 
 
765 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
710 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1223 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  26.3 
 
 
751 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
785 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
921 aa  84.7  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
761 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
969 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
973 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
1267 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
1166 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
1166 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
639 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.29 
 
 
948 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
851 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
758 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
681 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 
1002 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  27.59 
 
 
826 aa  81.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1959 aa  80.9  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  28.34 
 
 
1125 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  21.31 
 
 
932 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  23.76 
 
 
925 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
929 aa  80.5  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
817 aa  80.5  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
458 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 
866 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
775 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
656 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
1140 aa  80.1  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
479 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
401 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
917 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
786 aa  79.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  35.51 
 
 
378 aa  79.7  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
775 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1120 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.91 
 
 
1653 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  31.4 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
650 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 
1310 aa  79.7  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
683 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
901 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
674 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  23.93 
 
 
937 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 
1125 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  28.17 
 
 
1560 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
418 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
833 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
1043 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
929 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.16 
 
 
1271 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
873 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  33.76 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
919 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.52 
 
 
982 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
929 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
917 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.59 
 
 
922 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.42 
 
 
1346 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  22.34 
 
 
927 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.1 
 
 
956 aa  77.8  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1691 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
640 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
1333 aa  77.8  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
1075 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>