139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1154 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  61.17 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  57.61 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  62.65 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  59.04 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  66.27 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.51 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2793  hypothetical protein  55.91 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.19 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1009  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.65 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  40.62 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  39.86 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.92 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  39.77 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  36.05 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  36.24 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.89 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  39.78 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  35.04 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.18 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  33.57 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  42.25 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.25 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  30.6 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  32.17 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  32.17 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  32.17 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11260  Sec-independent protein secretion pathway component  46.67 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.639337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.83 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.45 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.6 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.24 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  34.48 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  32.67 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  40.98 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  33 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.43 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  40.74 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  42.59 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  37.7 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  38.89 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.23 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  32.04 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.32 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.11 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  36.54 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  38.3 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.78 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  40.74 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36.07 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  34.59 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.51 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  38.89 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  31.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.27 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  42.59 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  32.86 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  24.76 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  29.03 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  31.01 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  41.67 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  29.23 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.29 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  27.27 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.19 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.24 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  30.85 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  27.35 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  30.36 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.24 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  35.19 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.68 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>