100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0664 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  100 
 
 
130 aa  246  7e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  77.89 
 
 
135 aa  148  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  77.89 
 
 
138 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  48.67 
 
 
132 aa  117  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  49.56 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  45.45 
 
 
148 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1119  sec-independent translocase  40.74 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000270209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1452  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.2 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.401739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  29.57 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1655  sec-independent translocase  46.97 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  31.54 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  31.11 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  32.43 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  30.16 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  29.41 
 
 
231 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  40.32 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.23 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.09 
 
 
234 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  25.62 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.71 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  27.27 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.09 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  27.68 
 
 
229 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.82 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  28.32 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  23.61 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  25 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  25 
 
 
182 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  25 
 
 
182 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.58 
 
 
214 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  25 
 
 
182 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  25 
 
 
182 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  21.37 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.48 
 
 
254 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.03 
 
 
197 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.66 
 
 
208 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 
151 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.35 
 
 
189 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.09 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  31.82 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  40 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2974  putative TatB protein (twin arginine translocation)  31.08 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.37 
 
 
231 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  35.48 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.94 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  22.78 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.69 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.27 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.23 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2822  putative TatB protein (twin arginine translocation)  29.33 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  28.4 
 
 
170 aa  43.9  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.78 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  25.23 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  29.85 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.31 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  36.84 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.67 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.05 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  25.23 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  36.36 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  33.33 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  28.38 
 
 
182 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.26 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.78 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  29.41 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  32.69 
 
 
123 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  39.58 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30 
 
 
120 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  22.12 
 
 
170 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.76 
 
 
198 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  29.41 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  36.36 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.39 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  27.03 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  24.05 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.39 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  22.66 
 
 
164 aa  40.8  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  27.03 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  32.69 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  27.03 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.44 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  27.03 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  27.03 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  27.03 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.18 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  30.36 
 
 
157 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  34.33 
 
 
76 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>