138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0381 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  100 
 
 
105 aa  214  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  73.33 
 
 
102 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1187  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.3 
 
 
118 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  46.34 
 
 
123 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  56.96 
 
 
179 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  47.57 
 
 
194 aa  95.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.83 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  40.18 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.91 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.8 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  51.79 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  30.23 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  40.85 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  38.64 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  40.85 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.25 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  34.44 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  34.44 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  34.44 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  35.16 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.11 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.43 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.48 
 
 
214 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.39 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0713  hypothetical protein  45.31 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  29 
 
 
202 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  29.58 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.27 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  44 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  33.33 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  36.67 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  36.67 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.84 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.46 
 
 
88 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.78 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.7 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.33 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.74 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0601  sec-independent translocase  33.9 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.836249  normal  0.0805568 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  42.19 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.85 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  38.18 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
128 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  37.04 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  37.04 
 
 
231 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  37.5 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  40 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  35.21 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.19 
 
 
203 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  37.5 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  40.43 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  35.37 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  36.54 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  38 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  36 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.89 
 
 
207 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.9 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19400  twin arginine-targeting protein translocase TatB  36.47 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.572351  normal  0.0156187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  29.63 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.29 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  40 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  36.54 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  35.19 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.82 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.82 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  27 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.85 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  36.17 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  41.67 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  35.19 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.5 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  35.19 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  32.69 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  36.54 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  34.62 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.34 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  43.9 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32.73 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  34.85 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  27.27 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.48 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.55 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  29.79 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  38.3 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  32.18 
 
 
90 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>