197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4052 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  79.7 
 
 		 203 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  68.79 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  59.74 
 
 		 171 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  66.91 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  79.25 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  79.25 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  79.25 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  79.25 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  79.25 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  66.67 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  66.18 
 
 		 188 aa  147  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  63.19 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  63.19 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  48.51 
 
 		 184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  50 
 
 		 125 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  50 
 
 		 132 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  56.52 
 
 		 102 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  52 
 
 		 132 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.12 
 
 		 136 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  53.12 
 
 		 125 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  50.51 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  48.96 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  54.72 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.88 
 
 		 99 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.76 
 
 		 132 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.07 
 
 		 132 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  58.76 
 
 		 132 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.76 
 
 		 147 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.76 
 
 		 147 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.69 
 
 		 134 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.76 
 
 		 158 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.7 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.7 
 
 		 132 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.7 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.7 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.7 
 
 		 166 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.73 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  52.29 
 
 		 149 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.64 
 
 		 131 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  50 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  32.28 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.38 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  44.19 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.49 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  42.65 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.52 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  35.53 
 
 		 104 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  34.74 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  36.96 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  39.33 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  37.5 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  32.14 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  31.31 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.23 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.59 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  38.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  34.18 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  31.53 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  37.5 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  39.34 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  31.91 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.36 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  27.45 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.82 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  25.97 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.89 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  35.8 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  58.54 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  32.91 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  32.91 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  32.91 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.5 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  27.71 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.33 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.57 
 
 		 88 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.37 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.25 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.24 
 
 		 96 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  37.7 
 
 		 126 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  41.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  29.03 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.07 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.82 
 
 		 146 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  30.77 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>