49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3637 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  99.45 
 
 		 220 aa  357  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  98.9 
 
 		 220 aa  355  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  79.55 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320586 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  65.38 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  58.14 
 
 		 171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  63.89 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  57.48 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  57.48 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  57.48 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  57.48 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  69.15 
 
 		 190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.94 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.86 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.72 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  50.77 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.58 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.58 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.58 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  47.3 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  50.77 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  54.39 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.15 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.3 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.87 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.14 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.87 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  54.39 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  46.15 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  44.05 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.54 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.18 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  47.62 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.83 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  47.46 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  44.83 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  42.11 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>