209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0252 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  69.81 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  69.33 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  69.33 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  69.33 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  69.33 
 
 		 182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  68.67 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  69.93 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  76.43 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  76.43 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.09 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  64.79 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.22 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  68.91 
 
 		 182 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.87 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  59.63 
 
 		 132 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  64.52 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  56.91 
 
 		 125 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  58.49 
 
 		 132 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  65.22 
 
 		 102 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  51.28 
 
 		 125 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  57.29 
 
 		 133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.39 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  50 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.65 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  61.68 
 
 		 132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.04 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.77 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.77 
 
 		 171 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.89 
 
 		 132 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.78 
 
 		 132 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.45 
 
 		 147 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.45 
 
 		 147 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  63.92 
 
 		 134 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.89 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.62 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.82 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.79 
 
 		 131 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  55.26 
 
 		 149 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  51.04 
 
 		 99 aa  87.8  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.02 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  37.4 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  43.69 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  37.78 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  42.03 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  36.08 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.62 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.63 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3988  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.35 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.900518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.35 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  26.84 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  31.96 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  31.96 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  32.99 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  33.7 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  33.04 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.56 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  31.53 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.12 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.53 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  32.98 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  41.67 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.88 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.79 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  30.12 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.13 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.79 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  43.33 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  29.55 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.39 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  31.03 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  26.78 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.51 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  26.78 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  26.78 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  57.45 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  41.38 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  30.56 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  27.14 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  27.64 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.11 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  34.12 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  29.25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  29.25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  49.09 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  29.25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  37.97 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>