196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00561 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00561  sec-independent translocase  100 
 
 		 99 aa  201  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  73.74 
 
 		 99 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  57.58 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  57.29 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.06 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  54.17 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  51.02 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  51.02 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  50 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 203 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  47.47 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 197 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0523  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.16 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.926696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4100  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.16 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.994502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.48 
 
 		 190 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  46.88 
 
 		 182 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3377  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.16 
 
 		 132 aa  96.7  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.434126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  44.79 
 
 		 179 aa  96.7  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0471  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.14 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  45.83 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3796  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.1 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.67635  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  44.09 
 
 		 184 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3729  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3555  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0401  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3899  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0427  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0441  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0457  twin-arginine translocation protein TatB  54.08 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0415  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4203  Sec-independent protein translocase protein TatB  53 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0502  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.28 
 
 		 151 aa  84.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0275  twin arginine-targeting protein translocase TatB  51.04 
 
 		 220 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3941  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.04 
 
 		 220 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0252  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.04 
 
 		 188 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3759  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.42 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  38.37 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  41.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.26 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.88 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  41.54 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  36.23 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  41.54 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  34.69 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.62 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  42.25 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  34.83 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  34.02 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.92 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.9 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  50 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3637  Sec-independent protein translocase protein TatB  44.83 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  30.61 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.9 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.33 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  39.39 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  32.94 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.37 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.41 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.53 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  39.24 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  40.91 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.24 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  39.39 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0220  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.48 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  39.24 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.54 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  22.22 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.13 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  25.84 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  27.84 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.66 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  36.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  36.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  36.71 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  34.02 
 
 		 178 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.29 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  28.71 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.14 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.77 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.62 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  40.51 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.33 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>