203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4406 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
169 aa  327  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.2 
 
 
198 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.27 
 
 
159 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.81 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.16 
 
 
173 aa  117  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  60.47 
 
 
200 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.57 
 
 
153 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  59.09 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  44.87 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  62.67 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  66.67 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  57.3 
 
 
178 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  60.76 
 
 
169 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.39 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  49.56 
 
 
222 aa  94.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.08 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  45.92 
 
 
316 aa  84.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  52.24 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  39.45 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  42.4 
 
 
206 aa  84  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  43.88 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  43.88 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  51.47 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  44.9 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  46.94 
 
 
201 aa  80.5  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  44.9 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.09 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.72 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.67 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.27 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  46.67 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  33.86 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  42.31 
 
 
231 aa  67.4  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  30.87 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.11 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  30.87 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  30.87 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  30.87 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.24 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  30.49 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  32.59 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.92 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36.67 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  37.04 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.97 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  31.37 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  39.51 
 
 
118 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  33.1 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0955  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.18 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  36.29 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  32.09 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  37.76 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  32.09 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  32.09 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  45.31 
 
 
104 aa  60.8  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.69 
 
 
234 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  32.06 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.29 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  31.3 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  31.3 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  30.36 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  30.53 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  31.3 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.54 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  35.48 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  30.53 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  30.53 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  30.53 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  37.5 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  43.24 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  42.55 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  37.65 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.75 
 
 
122 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  37.5 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  36.25 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  33.33 
 
 
125 aa  58.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  41.54 
 
 
133 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  30.77 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  39.58 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  29.84 
 
 
132 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  39.47 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  39.78 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.71 
 
 
140 aa  57.8  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  34.17 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.67 
 
 
126 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  33.96 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.37 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  32.74 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>