281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0022 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  80.41 
 
 
103 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.56 
 
 
88 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  75.81 
 
 
88 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.13 
 
 
106 aa  94  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  47.27 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.72 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.73 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  61.02 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.73 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.61 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  73.77 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000524898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.37 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3587  twin arginine translocase protein A  73.77 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  47.3 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  52.54 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  43.33 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  52.54 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  44.09 
 
 
91 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.78 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.06 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.06 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  42.19 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  45.76 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  49.21 
 
 
60 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  60.47 
 
 
56 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  44.74 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
57 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.33 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  36.46 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.33 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.33 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  43.53 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  62.79 
 
 
59 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  41.03 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.92 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  38.46 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0693  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  58.46 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0696198  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.57 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.35 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  46.88 
 
 
120 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.82 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.1 
 
 
214 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0093  Sec-independent protein secretion pathway components  52.86 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0975952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  59.09 
 
 
55 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  35.85 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  61.54 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  32.08 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.38 
 
 
169 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  44.62 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  42.62 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  42 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  34.74 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  36.79 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.94 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  42 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  43.64 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  36 
 
 
200 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.62 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  43.64 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.36 
 
 
234 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  36.71 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.03 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.59 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.59 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  35.82 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  35.11 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.41 
 
 
94 aa  52  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.08 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.88 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  34.52 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.89 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.08 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  41.94 
 
 
123 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  30.3 
 
 
154 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  32.18 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>