167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1488 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  100 
 
 
208 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  82.86 
 
 
203 aa  284  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2667  SEC-independent protein translocase protein  67.91 
 
 
316 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  56.85 
 
 
222 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0874  sec-independent translocase  51.11 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.817267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2344  sec-independent translocase  52.8 
 
 
206 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0883  sec-independent translocase  55.96 
 
 
203 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1805  sec-independent translocase  50.36 
 
 
201 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.16 
 
 
169 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.34 
 
 
157 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.81 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.27 
 
 
153 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.62 
 
 
153 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.62 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.81 
 
 
159 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  44.09 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  45.98 
 
 
172 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  39.45 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  39.34 
 
 
180 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  51.47 
 
 
180 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 
178 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.63 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  40.19 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.11 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.17 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.8 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  46.38 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  35.71 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3028  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.71 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300806  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.66 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  36.14 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  33.96 
 
 
118 aa  61.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  42.65 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  38.1 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0588  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.86 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.12 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  32.17 
 
 
125 aa  58.9  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  37.5 
 
 
120 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.76 
 
 
151 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  38.03 
 
 
104 aa  58.2  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.42 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31.25 
 
 
133 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 
122 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.91 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.85 
 
 
96 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  29.03 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.87 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  34.41 
 
 
104 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  26.62 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  29.03 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  29.03 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  29.03 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  29.03 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  29.03 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  38.03 
 
 
122 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  29.81 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  30.53 
 
 
142 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.85 
 
 
126 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  27.59 
 
 
139 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  29.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.43 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.72 
 
 
190 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.29 
 
 
128 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.94 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  37.29 
 
 
157 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  36.99 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6059  twin-arginine translocation system protein, TatB  56.45 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1144  twin-arginine translocation protein TatB  45.59 
 
 
125 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.5 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 
99 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1200  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.45 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0829593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3929  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  32.88 
 
 
132 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  31.37 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  27.72 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  32.88 
 
 
132 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  38.24 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3362  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.35 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  57.5 
 
 
110 aa  49.3  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  26.4 
 
 
142 aa  49.3  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  35.29 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.31 
 
 
152 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  26.88 
 
 
179 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
96 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  26.53 
 
 
162 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  32.93 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  39.06 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
96 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  29.91 
 
 
125 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  29.91 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  23.39 
 
 
164 aa  48.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>