180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1574 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  77.34 
 
 
132 aa  207  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  61.26 
 
 
148 aa  147  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1119  sec-independent translocase  57.25 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000270209  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  58.89 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  49.56 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  58.89 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1452  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.94 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.401739  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1655  sec-independent translocase  55.13 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  37.63 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  30.43 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  26.81 
 
 
231 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  28.33 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.41 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  26.5 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  26.5 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.53 
 
 
254 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  29.17 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  27.69 
 
 
229 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  33.75 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.68 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.6 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  27.35 
 
 
178 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.38 
 
 
208 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.41 
 
 
234 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.97 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  29.76 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.52 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.92 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  22.83 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.77 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  25.66 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  27.5 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  27.36 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  27.56 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  27.5 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  27.5 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  27.5 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.12 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.1 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  27.5 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.21 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.4 
 
 
157 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.86 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.38 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  27.5 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  22.79 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  31.87 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.67 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.04 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.4 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  27.36 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  38.24 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  26.87 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  36.36 
 
 
202 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.58 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  34.38 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.88 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  28.7 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  36.9 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  26.42 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  26.67 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  26.42 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  26.42 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  26.42 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  23.68 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.29 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  26.67 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  36.25 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.9 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.77 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.38 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  31.18 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.9 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  33.85 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  32.79 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.31 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  28.36 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.78 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  27.62 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>